Ο Χουάν Μαγιόργκα γεννήθηκε στη Μαδρίτη το 1965. Το 1988 αποφοίτησε από τα τμήματα Φιλοσοφίας και Μαθηματικών. Συνέχισε τις σπουδές του στο Μύνστερ, το Βερολίνο και το Παρίσι. Το 1997 ολοκλήρωσε τη διδακτορική του διατριβή στη Φιλοσοφία (Συντηρητική επανάσταση και επαναστατική συντήρηση. Πολιτική και μνήμη στο έργο του Βάλτερ Μπένζαμιν.) Δίδαξε Μαθηματικά στη Μαδρίτη και στο Αλκαλά δε Ενάρες. Είναι καθηγητής Δραματουργίας και Φιλοσοφίας στην Ανώτατη Βασιλική Ακαδημία Θεάτρου της Μαδρίτης (RESAD) και ιδρυτικό στέλεχος του Θεατρικού Οργανισμού “El Astillero”.
Είναι μέλος της Βασιλικής Ακαδημίας της Ισπανίας από τις 12/4/2018 (Έδρα Μ)
Μερικά από τα θεατρικά του έργα είναι: Siete hombres buenos (Επτά καλοί άνθρωποι), Más ceniza(Κι άλλη στάχτη), El traductor de Blumemberg (Ο μεταφραστής του Μπλούμεμπεργκ, Μετάφραση στα ελληνικά: Λ. Καρατζάς Εκδόσεις Καστανιώτη, 2003), El jardín quemado (Ο καμμένος κήπος), Cartas de amor a Stalin (Γράμματα αγάπης στον Στάλιν), El Gordo y el Flaco (Ο Χοντρός και ο Λιγνός), Sonámbulo (Υπνοβάτης), Himmelweg, ο δρόμος για τον ουρανό, Animales nocturnos (Νυκτόβια ζώα), Palabra de perro (Ο λόγος του σκύλου), Η αιώνια ειρήνη, Últimas palabras de Copito de Nieve (Τα τελευταία λόγια του Χιονονιφάδα), Job (Ιώβ), Hamelin, El chico de la última fila (Το αγόρι στο τελευταίο θρανίο), Φαίδρα, La tortuga de Darwin (Η χελώνα του Δαρβίνου), Ο κριτικός, Εμπρός της γης οι κολασμένοι, Οι Γιουγκοσλάβοι, Ρέικιαβικ, Ο χαρτογράφος, Ο μάγος, Γκόλεμ κ.ά.
Έχει γράψει επίσης πολλά μονόπρακτα και έχει διασκευάσει έργα των Καλδερόν, Λόπε δε Βέγα, Ίψεν, Ντύρενματ, Ντοστογιέφσκι, Λέσσινγκ, Βάγιε Ινκλάν κ.ά. Έργα του έχουν παρουσιαστεί σε θέατρα της Αργεντινής, της Κροατίας, της Ιρλανδίας, της Ισπανίας, των ΗΠΑ, της Πορτογαλίας, της Αγγλίας, της Γαλλίας, της Ουκρανίας, της Κορέας, της Κούβας, της Ιταλίας, της Ελλάδας, της Ουρουγουάης και της Βενεζουέλας και έχουν μεταφραστεί στην αραβική, γαλλική, ελληνική, αγγλική, ιταλική, σερβοκροατική, ρουμανική, γερμανική, κορεατική, ιαπωνική, ουκρανική και πορτογαλική.
Τα περισσότερα έργα του έχουν βραβευτεί στην Ισπανία και έχουν κερδίσει σημαντικές διακρίσεις διεθνώς.
Στις 21 Νοεμβρίου 2007 τιμήθηκε με το Εθνικό Βραβείο Θεάτρου για την προσφορά του στο ισπανικό θέατρο και τη συμβολή του στην παγκόσμια διάδοσή του. Τον Ιανουάριο του 2008 τιμήθηκε με 2 βραβεία ΜΑΧ για Το αγόρι στο τελευταίο θρανίο και τη διασκευή του έργου τού Ίψεν Ο εχθρός του λαού.
Τα τελευταία χρόνια ασχολείται και με τη σκηνοθεσία έργων του, με τον θίασό του που λέγεται La loca de la casa (Η τρελή του σπιτιού). Τα έργα του που έχει σκηνοθετήσει είναι τα εξής: Η γλώσσα κομμάτια (για την Αγία Τερέζα του Ιησού), Ρέικιαβικ, Ο μάγος, Μπλε ελεκτρίκ, Ο χαρτογράφος, Σιωπή.
Στην Ελλάδα για πρώτη φορά ανέβηκε το έργο του Νυκτόβια ζώα, τον Μάρτιο του 2008 στο θέατρο Πολιτεία από τον θίασο Συν-θήκη σε σκηνοθεσία Κωστή Καπελώνη.
Το 2019 ανέβηκε στο Φεστιβάλ Αθηνών (Πειραιώς 260) το έργο του Himmelweg, ο δρόμος για τον ουρανό σε σκηνοθεσία Έλενας Καρακούλη.
Έχουν επίσης μεταφραστεί στην ελληνική γλώσσα τα έργα του: Αλέξανδρος και Άννα (το έγραψε σε συνεργασία με τον Χουάν Καβεστάνι), Η τέχνη της συνέντευξης, Το αγόρι στο τελευταίο θρανίο, Νυκτόβια ζώα (όλες οι μεταφράσεις έχουν γίνει από τη Μαρία Χατζηεμμανουήλ)